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环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?




        近几年关于 circRNA 的研究如火如荼,当前,我们也已经对 circRNA 有个大概的认识,比如什么是 circRNA、它是


怎么形成的以及它在不同物种不同组织中普遍存在。据 circBank 的不完全统计,人类细胞和组织中大约发现了 14 万条


circRNA转录本。这么多的 circRNA 到底具有什么样的功能呢,其实最终的问题是它对我们人类有什么用呢?有钱且疯狂


的中国研究者不惜将人类所有疾病都测序一遍,最后发现 circRNA 分子确实在疾病中差异表达了。


 

既然有差异表达了,那究竟有什么影响呢?先来看看circRNA是什么?




        1.  circRNA(circular RNA,环状RNA)是一类具有闭合环状结构的非编码RNA分子,没有5′ 帽子结构和3′ poly


(A)结构,主要位于细胞质或储存于外泌体中,不受RNA外切酶影响,表达更稳定且不易降解,已被证明广泛存在于


多种真核生物体内。


        2. 根据环状RNA剪接来源的不同,将其分为外显子环化形成的环状RNA(exonic cirRNAs)和内含子环化形成的


环状RNA(cirRNAs)。大多数circRNA是由外显子环化而成,也有部分circRNA是由内含子环化而成的套索结构


(lariat)。同时由于circRNA含有大量的miRNA应答原件(MREs),能与AGO蛋白形成RNA诱导沉默复合体(RISC)


的催化核心,最终导致circRNA降解。



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按来源归类CircRNA的种类




①全外显子型的circRNA;


②内含子和外显子组合的EICircRNA;


③内含子组成的套索型ciRNA;


④由病毒RNA基因组、tRNA、rRNA、snRNA等环化产生的circRNA。


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circRNA生物学功能




       circRNA主要存在于细胞质或外泌体中,具有组织特异性、疾病特异性、时序特异性及高稳定性等特征。近几年,大


量的研究表明circRNA在生物的生长发育、胁迫应答、疾病发生和发展等方面密切相关,并预测其在疾病诊断标记物等方


面的应用前景,但其生物学功能在很大程度上仍然未知。目前认可度比较高的circRNA生物学功能,归类如下:

 

  1. miRNA sponge:circRNA富含miRNA结合位点来充当miRNA海绵作用,阻止miRNA在3′ 非翻译区与mRNA相互

 

作用,进而间接调控miRNA下游靶基因的表达。

 

  2.调控蛋白结合:circRNA通过与mRNA调节的结合蛋白(RBP)结合,进而改变剪接模式或mRNA稳定性。

 

  3.调控基因转录:circRNA与RNA聚合酶Ⅱ相互作用并调节转录,或者EIcircRNA可与小核糖核蛋白互作用,再与RNA聚


合酶Ⅱ结合。

 

  4.编码功能:circRNA虽然属于非编码RNA,但也有部分circRNA可被核糖体翻译并编码多肽,进而行使调控功能。



 

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技术流程



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服务优势



    1.成环效率好,稳定性高


circRNAs 表达载体上加有艾基生物独家研发的上下游环化框架,对各种长度的目标序都有很好的环化效果;目前验证过的


所有 circRNAs 环化效率都在50% 以上,能有效保证至少100倍以上过表达效率。


2.便捷服务


可提供预测circRNA编码能力,提供circRAN的ID号,物种即可,订购构建服务,免费赠送1ug总量的阴性对照质粒。


3.序列环化准确


环化框架内部引入的特异环化介导序列可有效保证目标 circRNAs 的线性序列精确环化。


4.系统多样性高


可提供基于细胞瞬时,慢病毒的表达系统;也可提供表达GFP荧光或着嘌呤霉素等抗性基因的系统,以便利于筛选。



现有环化载体




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我司客户发表的部分与本服务相关SCI文章



【1】Wei Dong ,Junming Bi ,Hongwei Liu ,Dong Yan ,Qingqing He ,Qianghua Zhou ,Qiong Wang 

Circular RNA ACVR2A suppresses bladder cancer cells proliferation and metastasis through miR-626/EYA4 axis

Molecular Cancer. 2019 May 17;18(1):95. doi: 10.1186/s12943-019-1025-z.  

PMID: 31101108;PMCID: PMC6524247

 

【2】Yinjie Su ,Weilian Feng ,Juanyi Shi,Luping Chen , Jian Huang , Tianxin Lin .

circRIP2 accelerates bladder cancer progression via miR-1305/Tgf-β2/smad3 pathway

Molecular Cancer. 2020 Feb 4;19(1):23. doi: 10.1186/s12943-019-1129-5. PMID: 32019579 PMCID: PMC6998850

 

【3】Dong Yan,Wei Dong,Qingqing He, Meihua Yang, Lifang Huang, Jianqiu Kong,,Haide Qin.

Circular RNA circPICALM sponges miR-1265 to inhibit bladder cancer metastasis and inflfluence 

FAK phosphorylation

EBioMedicine. 2019 Oct; 48: 316–331. doi: 10.1016/j.ebiom.2019.08.074.PMCID: PMC6838432;PMID: 31648990

 

【4】Weikai Xiao,Shaoquan Zheng,Yutian Zou, Anli Yang,Xinhua Xie.

CircAHNAK1 inhibits proliferation and metastasis of triple-negative breast cancer by modulating miR-421 and RASA1

Aging (Albany NY). 2019 Dec 31; 11(24): 12043–12056.doi: 10.18632/aging.102539.PMCID: PMC6949091;

PMID: 31857500

 

【5】Qingqing He , Lifang Huang ,Dong Yan, Junming Bi , Meihua Yang,Jian Huang , Tianxin Lin.

CircPTPRA acts as a tumor suppressor in bladder cancer by sponging miR-636 and upregulating KLF9

Aging (Albany NY). 2019 Dec 10;11(23):11314-11328.doi: 10.18632/aging.102530.PMID: 31821171 ;

PMCID: PMC6932899

 

【6】Haomin Li, Baoli Heng, Peng Ouyang, Xuexia Xie, Tingshun Zhang, Guo Chen, Zheng Chen, Kahong.

Comprehensive profling of circRNAs and the tumor suppressor function of circHIPK3 in clear cell renal carcino

Journal of Molecular Histology volume 51, pages317–327 (2020).https://doi.org/10.1007/s10735-020-09882-9





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